3D illustration (iStock)
La ville de Wuhan, en Chine, où la COVID-19 épidémie est apparue, a récemment lancé une campagne pour tester chacun de ses 11 millions d’habitants pour le virus.
Déjà, à moins de deux semaines dans le lecteur, la ville a testé environ 6,5 millions d’habitants, Le New York Times a rapporté le 26 Mai. Mais comment pourrait-tant de gens être testé si rapidement?
En plus de recruter des milliers de travailleurs de la santé et du personnel de soutien et de verser des centaines de millions de dollars dans la campagne, la ville a favorisé le lecteur via des tracts, les messages des réseaux sociaux et du haut-parleur annonces; de Wuhan aussi intensifié ses tests de diagnostic des capacités par la mise en commun des échantillons provenant de personnes différentes ensemble, et de les traiter en petits lots, selon le Times.
villes des états-UNIS pourraient adopter une semblable « regroupées de l’essai » de la stratégie à l’écran de nombreux résidents à la fois et de se tenir au courant des nouvelles vagues de l’infection, mais l’approche ne fonctionne tant que la prévalence globale de l’COVID-19 reste faible, les experts ont dit Live Science.
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« Si vous êtes surveiller une population à faible prévalence, c’est un moyen très efficace de trouver des épidémies », a déclaré le Dr James Zehnder, directeur de la Clinique de la Pathologie à l’Université de Stanford School of Medicine. « J’espère que la FDA [Food and Drug Administration] est favorable à la mise en œuvre de cette solution. »
Pros de la mutualisation de l’essai
Après environ un mois, sans aucune récemment confirmé des cas de COVID-19, Wuhan ont fait état de six nouveaux cas au cours de la semaine du 14 Mai, Le New York Times. Peu de temps après, le gouvernement de la ville a annoncé ses plans pour une intervention rapide et généralisée des tests de diagnostic du disque, visant à la volonté d’étouffer l’éventualité d’une deuxième vague d’infection. Alors que certains experts ont mis en doute la nécessité de tester la majorité de Wuhan de 11 millions d’habitants, quand un échantillon plus petit, pourrait être suffisante, la vérification approfondie de lecteur toujours en démontre l’utilité de la mutualisation de l’essai, selon le Times.
à Savoir, la technique permet de réaliser de nombreux tests de diagnostic pour être traité dans un court laps de temps, et avec un minimum de tests de matériaux, les experts ont dit Live Science.
Quand une épidémie démarre, il se propage rapidement — trop rapidement pour attraper, si vous n’êtes dépistage des personnes avec des symptômes manifestes de COVID-19, a déclaré Peter Frazier, professeur agrégé et titulaire de données scientifique à l’Université de Cornell, dont le laboratoire est la modélisation de la meilleure façon de mettre en œuvre regroupées des essais aux états-UNIS étant Donné que les personnes asymptomatiques peuvent propager le virus par le biais de la respiration et de la parole, par le temps, les personnes symptomatiques commencer à chercher des tests de diagnostic, l’éclosion peut être bien en cours.
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Mais, avec mise en commun des tests, une population donnée peut être projeté pour COVID-19 périodiquement; de cette façon, dite silencieuse épandeurs peuvent être identifiés et isolés, et leurs contacts récents peuvent être alerté d’une infection potentielle, Frazier a dit.
« C’est dur d’avoir un scénario dans lequel vous êtes à l’essai de chaque personne dans une population, » mais la stratégie pourrait être particulièrement utile pour le dépistage des groupes à haut risque, Zehnder a dit. Les écoles, les maisons de soins infirmiers et les établissements pénitentiaires, ainsi que les populations de travailleurs de la santé et les premiers intervenants, pourrait mettre en œuvre un calendrier de mise en commun de tests pour repérer les épidémies avant de courir hors de contrôle, dit-il.
Pour des tests à Wuhan, des travailleurs de la santé de prendre les échantillons prélevés à partir du nez et de la gorge de plusieurs personnes et de déposer les échantillons dans un seul tube en plastique, le Times a rapporté. Le lot d’échantillons peuvent être analysés à la recherche de preuves de matériel génétique viral grâce à une méthode de réaction en chaîne par polymérase (PCR).
Si l’ensemble de tube à essai de tests négatifs, tous les tampons à l’intérieur peut être considéré comme négatif pour le virus; si le tube de tests positifs, les échantillons inclus dans la mise en commun peut être testé individuellement pour déterminer l’échantillon contient des particules virales. Une partie de chaque prélèvement obtient habituellement réservés pour les besoins de ce nouveau test, de sorte que les gens n’avez pas à revenir à la site de test à écouvillonner un deuxième temps, Zehnder a dit.
Pour vous assurer que les résultats de la mise en commun des tests sont aussi précis que possible, les laboratoires doivent examiner attentivement la manière dont le nombre d’échantillons à inclure dans chaque lot, a déclaré Chris Bilder, une statistique professeur à l’Université de Nebraska-Lincoln, dont les études de laboratoire, l’utilisation des tests pour les maladies infectieuses, y compris les maladies sexuellement transmissibles.
parlons de la logistique
L’idéal « de la taille du pool » — nombre de tampons dans chaque échantillon groupé — dépend en grande partie sur la prévalence de la maladie dans une population donnée, Bilder dit. Si une grande partie de la population a COVID-19, nombre de mis en commun les tests reviennent positifs et nécessiter un traitement supplémentaire. À un certain point, mise en commun de tests cesse d’être efficace et le laboratoire doit revenir à la norme, des tests individuels, dit-il.
Par exemple, en Mars, le Nebraska Laboratoire de Santé Publique a reçu l’approbation de la FDA pour l’utilisation pool de test pour COVID-19, aussi longtemps que le test positif des taux reste en dessous de 10% et des pools d’échantillons ne compte pas plus de cinq tampons de chacun, des Scientifiques Américains ont rapporté. Bilder et Brianna Hitt, a récemment obtenu leur diplôme de doctorat dans son laboratoire, a développé un outil facile à utiliser application qui a aidé le laboratoire de déterminer quelles tailles de piscine serait le mieux compte tenu de ces paramètres.
conçu à l’Origine avec de dépistage des MST à l’esprit, l’application peut être réorientés vers COVID-19 tests de diagnostic, Bilder dit. L’application prend prévalence de la maladie et à la précision du test en considération afin de déterminer quel est l’éventail de tailles de pool serait approprié. En outre, les utilisateurs peuvent comparer les différentes méthodes de mise en commun pour voir ce qui fonctionne le mieux pour leur échantillon particulier, at-il dit.
« La baisse de la prévalence est élevée, plus la taille du pool que vous pouvez utiliser, » dit-il.
Dites que vous faites des tests de 100 personnes et de la prévalence de la maladie est de 5%; avec la norme de test, vous pouvez utiliser 100 tests pour tester tout le monde et place une moyenne de cinq des infections actives. Avec mise en commun de test, vous pouvez forfaitaire tampons en groupes de cinq et seulement 20 tests dans le processus. Même si cinq groupes est revenu positif et nécessaire un nouveau test, vous devez utiliser uniquement 45 essais total par rapport à 100.
En plus de la prévalence de la maladie, les laboratoires doivent tenir compte d’un phénomène appelé « effet de la dilution » lors de la détermination des tailles de piscine, Frazier a dit. PCR machines peuvent traiter uniquement dans la quantité de liquide en une seule fois; le plus grand de la piscine de la taille augmente, plus la proportion de liquide apporté par chaque tige devient, dit-il. Positif de la tige contient un nombre fini de particules virales, l’élargissement de la taille du pool de réduire vos chances de repérer les quelques particules dans un lot de l’échantillon, dit-il.
Cet effet de dilution « fixe le plafond » pour votre piscine de taille, et « au-dessous de ce plafond, le droit de la taille du pool est fondée sur [la maladie] la prévalence. »
À vérifier pour des résultats faux, mise en commun de tests sont négatifs, peut être redistribué en légèrement plus grandes piscines et courir à travers la PCR, une fois de plus, un processus connu sous le nom de « retour de dépistage, » Bilder dit. Une autre méthode pour assurer l’exactitude, actuellement en cours de vérification par Frazier et ses collaborateurs à l’Université de Cornell, les pools d’échantillons dans une grille de colonnes et de rangées de tubes à essai. Si les deux une colonne et rangée parmi les échantillons sont positifs, le tube à leur intersection doit présenter une tige d’essai communes aux deux.
Pourrait-il être fait aux États-unis?
mis en Commun les tests ont fait surface au cours de la seconde Guerre Mondiale, quand le personnel militaire a reçu un large test pour la syphilis, les Scientifiques Américains ont rapporté. Depuis, cette approche a été utilisée à l’écran pour une variété de maladies, y compris le VIH, chlamydia et le paludisme.
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« Ce n’est pas nouveau, » Bilder dit. Méthodes de mise en commun de mise à l’essai maintenant juste besoin d’être redéfini pour COVID-19 essais, at-il dit.
Avant de pool de test peut être largement mises en œuvre, chaque projet de protocole doit d’abord obtenir l’approbation de la FDA, Frazier ajouté. Malgré ce potentiel obstacle réglementaire, le fait que le Nebraska Laboratoire de Santé Publique gagné l’approbation conditionnelle suggère un précédent pour l’avenir commun des essais, at-il dit.
au-Delà de l’élaboration de protocoles et de gagner l’approbation de la FDA, les laboratoires qui souhaitent mener des collectifs, des essais doivent évaluer « qui doit être testé et combien de fois, » Zehnder dit. Encore une fois, les groupes à haut risque pourrait être une priorité pour les plus fréquents essais, des échantillons représentatifs de l’ensemble de la population pourrait être perçue moins fréquemment à titre de comparaison, dit-il. Si la limitation effective du virus nécessite des tests populations tous les trois jours, une fois par semaine ou deux fois par mois, sera susceptible de varier selon l’emplacement et des besoins relatifs, dit-il.
Et, bien commun de l’échantillonnage ne aider à la conservation de matériel d’analyse, d’une infrastructure solide et doivent être en place pour organiser la collecte des échantillons et de la distribution des résultats, Zehnder ajouté. « La façon la plus simple est que si les gens peuvent écouvillon eux-mêmes et de l’envoyer dans, » ainsi éviter potentiellement voyage risqué pour un test physique du site, at-il dit. Une fois les échantillons peuvent être collectées et traitées, il doit y avoir un moyen d’utiliser cette information pour guider une intervention de santé publique, qui permettrait notamment à rechercher les risques d’infections et d’isoler les cas positifs dans la communauté, dit-il.
mis en Commun les tests, seul, ne peut pas étouffer les épidémies; la mesure doit être couplé avec le respect des membres de la communauté et efficace de mesures de santé publique, comme généralisée de la recherche des contacts, Zehnder a dit.
« C’est la conversation, les gens ont besoin d’avoir que l’économie commence à s’ouvrir, » dit-il.
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publié à l’Origine sur Live Science.
