le 21 Mars 2019, Berlin: Médical, les expositions peuvent être trouvés dans l’exposition « Auf Messers Schneide » dans l’Histoire Médicale du Musée de la Charite – fichier photo. (Photo par Monika Skolimowska/picture alliance via )
Un malade du poumon humain, fixe dans l’agent de conservation au formol depuis plus de 100 ans, a aidé les scientifiques à retracer l’histoire du virus de la rougeole et de son origine dès le sixième siècle B. C.
Pendant des années, le poumon assis dans le sous-sol de Berlin, le Musée d’Histoire de la médecine avec des centaines d’autres échantillons pulmonaires, tous recueillis et conservés entre les années 1870 et 1930. Sur une chasse pour bien conservé pathogènes des voies respiratoires, virologue Sébastien Calvignac-Spencer de l’Institut Robert Koch et son équipe de recherche est descendu dans le sous-sol et regarda dans chaque bocal. « C’est une question de sérendipité » que l’équipe a trouvé un poumon appartenant à une de 2 ans contre la rougeole des patients qui sont morts de la maladie en 1912, Calvignac-a déclaré Spencer.
L’équipe est parvenue à extraire des échantillons du virus à partir de 108 ans, le tissu pulmonaire et a utilisé le matériel génétique — la plus ancienne de la rougeole génome jamais séquencé — pour en savoir plus sur les origines de l’agent pathogène. Dans une nouvelle étude, publiée aujourd’hui (le 18 juin) dans la revue Science, ils estiment que la rougeole pourrait ont divergé à partir de sa plus proche, un maintenant éradiquée bovins virus, dès 528 B. C.
La nouvelle estimation suggère que le virus peut être « plus de 1 000 ans de plus que toute estimation précédente, » Calvignac-Spencer dit Live Science.
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l’Un des rares à trouver
les études Précédentes ont prédit que le vaccin contre la rougeole et la éteintes bovins virus, appelé la peste bovine, la scission de leur plus récent ancêtre commun entre le 11ème et 12ème siècles, selon un rapport publié en 2011 dans la revue de Biologie Moléculaire et de l’Évolution (MBE). Cependant, le persan médecin Muhammad ibn Zakariya al-Razi a écrit une description clinique de la rougeole dans le 10ème siècle, de sorte que quelque chose n’a pas ajouté.
« La scission entre la rougeole et de la peste bovine est clairement sous-estimé », a déclaré Joel Wertheim, auteur de la MBE rapport et professeur adjoint de médecine à l’Université de Californie, San Diego, qui n’était pas impliqué dans la nouvelle étude sur la Science. Ces sous-estime surviennent à partir de deux questions essentielles: l’absence de l’ancien rougeole échantillons et les fausses hypothèses sur la façon de mutation du virus à travers le temps, qui biaiser les modèles d’évolution vers une « ridiculement date récente, » Wertheim dit Live Science.
Wertheim et ses co-auteurs ont construit un nouveau modèle pour tenir compte de ces facteurs et a repoussé l’origine date de la fin du dix-neuvième siècle, mais « nous ne pense pas que nous étions en droit, » dit-il. Maintenant, Calvignac-Spencer et son équipe ont atteint une estimation plus réaliste, en partie, y compris récemment découverts en 1912 spécimen dans leur analyse, Wertheim dit.
Avant que l’équipe a trouvé l’1912 échantillon, la plus ancienne de la rougeole génome jamais séquencé daté de 1954, les auteurs ont noté. Les scientifiques estiment que les taux de changement évolutif, ou de combien et à quelle vitesse un virus mute, en comparant les échantillons recueillis à différents moments et de suivi des différences dans leur code génétique. Les plus âgés et des échantillons que nous examinons, la plus claire que le taux de change devient, Calvignac-a déclaré Spencer.
Mais l’épine dorsale du virus de la rougeole est l’ARN, un type de matériel génétique qui se dégrade vite par rapport à son plus solide cousin de l’ADN. L’1912 échantillon échappé à ce sort parce que les poumons avaient été fixés dans du formol, un agent de conservation qui s’arrête de réactions chimiques qui seraient autrement dégrader l’ARN. Formol aussi « colles » les conserves de l’ARN à proximité de molécules, il est difficile d’extraire, de Calvignac-a déclaré Spencer.
Pour décoller les ARN, l’équipe tranches de 0,007 onces (200 mg), de tissu du poumon et de la bouillie le petit échantillon, provoquant le collant molécules à l’intérieur de se séparer sans détruire l’ARN. L’équipe a ensuite construit une quasi complète du génome » de l’sauvé de l’ARN, ont-ils écrit. Pour enrichir encore leur modèle évolutionniste, l’équipe a parcouru la collecte d’échantillons génétiques allemand dans le Laboratoire National de Référence et a trouvé deux rougeole échantillons prélevés en 1960 à ajouter à leur analyse.
Immeuble de meilleurs modèles
L’équipe a construit leur modèle évolutif de la 1912 exemple, 1960 échantillons et 127 échantillons supplémentaires, la plupart collectées ou après les années 1990. Un deuxième modèle, comparativement à environ 50 rougeole séquences du virus de la peste bovine, qui a été déclarée éradiquée en 2011, et son parent le plus proche de la peste des petits ruminants (PPRV), qui infecte les chèvres et les moutons, à la broche vers le bas lorsque ces agents pathogènes split à partir de leur commun ancêtre.
Dans ces deux modèles, l’équipe a pris un phénomène appelé « sélection purificatrice » en compte, qui fait l’objet de nombreuses études négligé, Calvignac-a déclaré Spencer. Alors que certaines pressions évolutives ajouter utile mutations dans le génome, et la maintenir stable au fil du temps, soi-disant la purification de sélection des purges nocifs des mutations dans le génome avant qu’ils peuvent s’accumuler. Ces forces complémentaires aider à définir le rythme de l’évolution, de manière à estimer au moment de la rougeole est apparue, vous devez facteur dans la sélection purificatrice, Wertheim dit.
« Vous pouvez changer [vos estimations] par un ordre de grandeur en prenant la purification de sélection en compte, » dit-il. Sélection purificatrice, en partie, les causes de certains segments du génome de muter facilement et souvent, alors que d’autres à peine le changement à tous, at-il ajouté. « Vous aurez plusieurs mutations de frapper la même position plus de et plus », mais puisque vous avez seulement un nombre limité d’échantillons, vous risquez de manquer certaines de ces mutations, Calvignac-a déclaré Spencer. L’équipe a conçu son modèle de saisir ces mutations qui pourraient autrement être manquées.
sur la Base lorsque la peste bovine et la rougeole ont divergé, la « première date possible pour la mise en place de la rougeole dans les populations humaines » s’est produite dans le sixième siècle B. C., bien que la date exacte que le premier virus de personnes infectées reste inconnue.
Les auteurs ont noté que, autour de 2 000 à 2 500 ans, les humains ont commencé la construction de colonies assez grande pour soutenir une épidémie de rougeole, offre le virus à l’occasion d’établir lui-même. La rougeole a tendance à pierre dans les collectivités de moins de 250 000 personnes, en tant que résidents vite devenue abri, ou de mourir de la maladie, de sorte que « les petites populations humaines ne pouvaient plus servir comme des morts de fin d’hôtes, » ont-ils écrit.
« j’ai été étonné quand j’ai vu qu’ils étaient en mesure de sortir un plus de 100 ans, le virus à partir de tissu de poumon, » Wertheim dit. Je pense que plus les virologues va commencer à l’aide de « plus vieux et plus de virus que les gens deviennent plus ambitieux et encouragés par ces résultats, » at-il ajouté.
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publié à l’Origine sur Live Science.
